Das Sekretariat der Schweizer Bischofskonferenz hat seinen Sitz in Freiburg i. Ü. Es gewährleistet die Verwaltung und das gute Funktionieren der SBK. Ausserdem beherbergt es die Kommunikationsstelle der SBK. Es besteht zum einen aus dem Generalsekretär, dem stellvertretenden Generalsekretär, einem Dokumentalisten, einem Buchhalter und zwei Sekretärinnen (deutsch- und französischsprachig), zum anderen aus den drei Informationsbeauftragten der SBK.